MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021881	TCT	2	6	166612	166617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464197
3502	NC_021881	TCC	2	6	166767	166772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464197
3503	NC_021881	AT	3	6	166824	166829	50 %	50 %	0 %	0 %	526464197
3504	NC_021881	GCG	2	6	166841	166846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464197
3505	NC_021881	AAT	2	6	166903	166908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464197
3506	NC_021881	ATGG	2	8	166935	166942	25 %	25 %	50 %	0 %	526464197
3507	NC_021881	ATT	2	6	166945	166950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464197
3508	NC_021881	GAT	2	6	166966	166971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464197
3509	NC_021881	TCC	2	6	167048	167053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464197
3510	NC_021881	TAC	2	6	167198	167203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464197
3511	NC_021881	AGTGT	2	10	167222	167231	20 %	40 %	40 %	0 %	526464197
3512	NC_021881	TA	3	6	167234	167239	50 %	50 %	0 %	0 %	526464197
3513	NC_021881	ATG	2	6	167282	167287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464197
3514	NC_021881	GAT	2	6	167389	167394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464197
3515	NC_021881	CGGCAT	2	12	167478	167489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526464197
3516	NC_021881	TA	4	8	167527	167534	50 %	50 %	0 %	0 %	526464197
3517	NC_021881	TGC	2	6	167577	167582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464197
3518	NC_021881	GT	3	6	167588	167593	0 %	50 %	50 %	0 %	526464197
3519	NC_021881	TAT	2	6	167611	167616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464197
3520	NC_021881	AG	3	6	167631	167636	50 %	0 %	50 %	0 %	526464197
3521	NC_021881	GTTGC	2	10	167680	167689	0 %	40 %	40 %	20 %	526464776
3522	NC_021881	CT	3	6	167744	167749	0 %	50 %	0 %	50 %	526464776
3523	NC_021881	CAT	2	6	167809	167814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464776
3524	NC_021881	ATA	2	6	167835	167840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464776
3525	NC_021881	GCA	2	6	167900	167905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464198
3526	NC_021881	C	6	6	167965	167970	0 %	0 %	0 %	100 %	526464198
3527	NC_021881	CAAG	2	8	167977	167984	50 %	0 %	25 %	25 %	526464198
3528	NC_021881	TTC	2	6	168062	168067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464198
3529	NC_021881	GAAA	2	8	168113	168120	75 %	0 %	25 %	0 %	526464198
3530	NC_021881	CT	4	8	168135	168142	0 %	50 %	0 %	50 %	526464198
3531	NC_021881	TGC	2	6	168288	168293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464198
3532	NC_021881	CCCA	2	8	168337	168344	25 %	0 %	0 %	75 %	526464198
3533	NC_021881	AGT	2	6	168407	168412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464198
3534	NC_021881	T	6	6	168424	168429	0 %	100 %	0 %	0 %	526464198
3535	NC_021881	ATC	2	6	168446	168451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464198
3536	NC_021881	TAT	2	6	168476	168481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464198
3537	NC_021881	TGA	2	6	168492	168497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464198
3538	NC_021881	AGAA	2	8	168587	168594	75 %	0 %	25 %	0 %	526464198
3539	NC_021881	TCC	2	6	168672	168677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464198
3540	NC_021881	TC	3	6	168683	168688	0 %	50 %	0 %	50 %	526464198
3541	NC_021881	AAGAT	2	10	168719	168728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021881	GAT	2	6	168750	168755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021881	GAA	2	6	168774	168779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021881	AGC	2	6	168809	168814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021881	TGC	2	6	168819	168824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021881	ATC	2	6	168827	168832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021881	AAC	2	6	168840	168845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021881	AT	3	6	168850	168855	50 %	50 %	0 %	0 %	526464199
3549	NC_021881	TTC	2	6	168896	168901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464199
3550	NC_021881	TCT	2	6	168973	168978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464199
3551	NC_021881	GCA	3	9	168985	168993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464199
3552	NC_021881	T	6	6	169015	169020	0 %	100 %	0 %	0 %	526464199
3553	NC_021881	TAT	2	6	169119	169124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464199
3554	NC_021881	AAT	2	6	169165	169170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464199
3555	NC_021881	ATC	2	6	169227	169232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464199
3556	NC_021881	CTA	2	6	169370	169375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464199
3557	NC_021881	ACA	2	6	169429	169434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464199
3558	NC_021881	CAG	2	6	169444	169449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464199
3559	NC_021881	TTC	2	6	169473	169478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464199
3560	NC_021881	CTT	2	6	169690	169695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464199
3561	NC_021881	TGA	2	6	169709	169714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464199
3562	NC_021881	TAT	2	6	169731	169736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464199
3563	NC_021881	T	6	6	169921	169926	0 %	100 %	0 %	0 %	526464200
3564	NC_021881	TCT	2	6	169965	169970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464200
3565	NC_021881	ATTA	2	8	170045	170052	50 %	50 %	0 %	0 %	526464200
3566	NC_021881	CCT	2	6	170067	170072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464200
3567	NC_021881	TTCA	2	8	170093	170100	25 %	50 %	0 %	25 %	526464200
3568	NC_021881	TTA	2	6	170179	170184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464200
3569	NC_021881	TCAGTA	2	12	170208	170219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526464200
3570	NC_021881	TA	3	6	170264	170269	50 %	50 %	0 %	0 %	526464200
3571	NC_021881	CCAC	2	8	170340	170347	25 %	0 %	0 %	75 %	526464200
3572	NC_021881	ATG	2	6	170355	170360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464200
3573	NC_021881	CTT	2	6	170374	170379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464200
3574	NC_021881	GA	3	6	170391	170396	50 %	0 %	50 %	0 %	526464200
3575	NC_021881	TGT	2	6	170407	170412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464200
3576	NC_021881	ACT	2	6	170434	170439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464201
3577	NC_021881	TAT	2	6	170451	170456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464201
3578	NC_021881	CAG	2	6	170497	170502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464201
3579	NC_021881	AGA	2	6	170525	170530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464201
3580	NC_021881	AGA	2	6	170542	170547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464201
3581	NC_021881	GCC	2	6	170560	170565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464201
3582	NC_021881	AG	3	6	170649	170654	50 %	0 %	50 %	0 %	526464201
3583	NC_021881	AAG	2	6	170723	170728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464201
3584	NC_021881	ACA	2	6	170736	170741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464201
3585	NC_021881	GCA	2	6	170742	170747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464201
3586	NC_021881	CCA	2	6	170773	170778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464201
3587	NC_021881	CAA	2	6	170814	170819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464201
3588	NC_021881	TTC	2	6	170888	170893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464201
3589	NC_021881	CAG	2	6	170911	170916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464201
3590	NC_021881	ACA	2	6	171065	171070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464201
3591	NC_021881	TGA	2	6	171079	171084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464201
3592	NC_021881	AAG	2	6	171089	171094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464201
3593	NC_021881	AGC	2	6	171211	171216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_021881	TAT	2	6	171364	171369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021881	TA	3	6	171374	171379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021881	GCT	2	6	171403	171408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_021881	TCT	2	6	171533	171538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464202
3598	NC_021881	TAT	2	6	171566	171571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464202
3599	NC_021881	ACA	2	6	171595	171600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464202
3600	NC_021881	CAA	2	6	171606	171611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464202
3601	NC_021881	ATT	2	6	171612	171617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464202
3602	NC_021881	GCA	2	6	171667	171672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464202
3603	NC_021881	GA	3	6	171680	171685	50 %	0 %	50 %	0 %	526464202
3604	NC_021881	AAG	2	6	171686	171691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464202
3605	NC_021881	ACT	2	6	171698	171703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464202
3606	NC_021881	GAA	2	6	171718	171723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464202
3607	NC_021881	GCA	2	6	171737	171742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464202
3608	NC_021881	ATA	2	6	171751	171756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464202
3609	NC_021881	AGA	2	6	171807	171812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464202
3610	NC_021881	GAT	2	6	171879	171884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464202
3611	NC_021881	GA	3	6	171885	171890	50 %	0 %	50 %	0 %	526464202
3612	NC_021881	GAA	2	6	171928	171933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464202
3613	NC_021881	AGA	2	6	171955	171960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464202
3614	NC_021881	TGA	2	6	171963	171968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464202
3615	NC_021881	AGC	2	6	171999	172004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464202
3616	NC_021881	CAG	2	6	172067	172072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464202
3617	NC_021881	ATT	2	6	172137	172142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464202
3618	NC_021881	AG	3	6	172143	172148	50 %	0 %	50 %	0 %	526464202
3619	NC_021881	AGA	2	6	172161	172166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464202
3620	NC_021881	TAGAA	2	10	172179	172188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021881	TAT	2	6	172224	172229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3623	NC_021881	TCT	3	9	172320	172328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3871	NC_021881	C	6	6	185490	185495	0 %	0 %	0 %	100 %	526464208
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3999	NC_021881	GTT	2	6	192016	192021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464212
4000	NC_021881	GATG	2	8	192037	192044	25 %	25 %	50 %	0 %	526464212

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